Isnin, 24 Jun 2013.-Para saintis dari Australia dan Amerika Syarikat memberikan pengetahuan baru kepada pemahaman struktur tiga dimensi genom, salah satu cabaran terbesar yang dihadapi dalam bidang genom dan genetik, yang kesimpulannya menerbitkan dalam edisi digitalnya ' Alam Genetik '.
Sekitar tiga meter DNA dilipat dengan rapat dalam nukleus setiap sel badan kita, yang membolehkan beberapa gen untuk "meluahkan" atau mengaktifkan, tidak termasuk yang lain. Doktor Tim Mercer dan John Mattick dari Institut Garvan untuk Penyelidikan Perubatan di Sydney dan Profesor John Stamatoyannopoulos dari University of Washington di Seattle menganalisis struktur 3D genom dengan resolusi tinggi.
Gen ini terdiri daripada "exons" dan "introns", yang pertama adalah urutan yang mengekod dan menyatakan protein, dan terakhir, terbentang DNA bukan pengekodan dalam medium. Sebagai gen disalin atau ditranskrit, dari DNA dalam RNA, urutan intron dipotong atau "disambung" dan baki exon dirantai bersama-sama untuk membentuk satu urutan pengekodan protein. Bergantung pada exon yang ditapis, gen yang sama boleh menjana protein yang berlainan.
Melalui penggunaan sejumlah besar data dari projek ENCODE, Dr. Tim Mercer dan rakan-rakannya telah menyimpulkan lipatan genom, mendapati bahawa dalam gen tertentu, exon yang dipilih mudah didedahkan. "Bayangkan pokok anggur yang panjang dan rumit, cawangan-cawangannya yang memancarkan beberapa buah anggur yang mudah rosak, sambil menyembunyikan orang lain di luar jangkauan mereka, " katanya. Mercer
"Pada masa yang sama, bayangkan pemetik buah yang malas hanya memetik buah anggur di hujung jari anda - dia menambah - Prinsip yang sama berlaku kepada genom. Gen khusus dan exon spesifik diletakkan dalam jangkauan lipatan." Dalam pengertian ini, penyelidik menunjukkan bahawa dalam tahun-tahun kebelakangan ini, saintis telah mula menghargai bagaimana lipatan genom membantu menentukan bagaimana ia dinyatakan dan dikawal.
"Kajian ini memberi petunjuk pertama bahawa struktur tiga dimensi genom dapat mempengaruhi splicing gen. Kita dapat menyimpulkan bahawa lipatan genom sedemikian rupa sehingga wilayah promoter, urutan yang memulakan transkripsi gen, adalah dijumpai di sebelah exon dan mereka semua dibawa ke jentera transkripsi, "tegasnya.
"Ini menyokong cara baru untuk melihat perkara-perkara, bahawa genom membelit di sekitar jentera transkripsi, bukan sebaliknya. Gen-gen yang bersentuhan dengan jentera transkripsi mendapatkan salinan, manakala bahagian-bahagian yang mengorbit jauh mereka diabaikan, "menyimpulkan penyelidik ini.
Sumber:
Tag:
Glosari Diet Dan Pemakanan Ubat-Ubatan
Sekitar tiga meter DNA dilipat dengan rapat dalam nukleus setiap sel badan kita, yang membolehkan beberapa gen untuk "meluahkan" atau mengaktifkan, tidak termasuk yang lain. Doktor Tim Mercer dan John Mattick dari Institut Garvan untuk Penyelidikan Perubatan di Sydney dan Profesor John Stamatoyannopoulos dari University of Washington di Seattle menganalisis struktur 3D genom dengan resolusi tinggi.
Gen ini terdiri daripada "exons" dan "introns", yang pertama adalah urutan yang mengekod dan menyatakan protein, dan terakhir, terbentang DNA bukan pengekodan dalam medium. Sebagai gen disalin atau ditranskrit, dari DNA dalam RNA, urutan intron dipotong atau "disambung" dan baki exon dirantai bersama-sama untuk membentuk satu urutan pengekodan protein. Bergantung pada exon yang ditapis, gen yang sama boleh menjana protein yang berlainan.
Melalui penggunaan sejumlah besar data dari projek ENCODE, Dr. Tim Mercer dan rakan-rakannya telah menyimpulkan lipatan genom, mendapati bahawa dalam gen tertentu, exon yang dipilih mudah didedahkan. "Bayangkan pokok anggur yang panjang dan rumit, cawangan-cawangannya yang memancarkan beberapa buah anggur yang mudah rosak, sambil menyembunyikan orang lain di luar jangkauan mereka, " katanya. Mercer
"Pada masa yang sama, bayangkan pemetik buah yang malas hanya memetik buah anggur di hujung jari anda - dia menambah - Prinsip yang sama berlaku kepada genom. Gen khusus dan exon spesifik diletakkan dalam jangkauan lipatan." Dalam pengertian ini, penyelidik menunjukkan bahawa dalam tahun-tahun kebelakangan ini, saintis telah mula menghargai bagaimana lipatan genom membantu menentukan bagaimana ia dinyatakan dan dikawal.
"Kajian ini memberi petunjuk pertama bahawa struktur tiga dimensi genom dapat mempengaruhi splicing gen. Kita dapat menyimpulkan bahawa lipatan genom sedemikian rupa sehingga wilayah promoter, urutan yang memulakan transkripsi gen, adalah dijumpai di sebelah exon dan mereka semua dibawa ke jentera transkripsi, "tegasnya.
"Ini menyokong cara baru untuk melihat perkara-perkara, bahawa genom membelit di sekitar jentera transkripsi, bukan sebaliknya. Gen-gen yang bersentuhan dengan jentera transkripsi mendapatkan salinan, manakala bahagian-bahagian yang mengorbit jauh mereka diabaikan, "menyimpulkan penyelidik ini.
Sumber:
