Selasa, 8 Julai 2014.- Satu pasukan penyelidik dari Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) telah mengambil bahagian dalam penyiasatan antarabangsa yang telah mengenal pasti 5 mikroba bakteria baru, yang belum diketahui sehingga kini, dalam microbiota manusia (flora usus).
Penyelidikan, di mana saintis telah menggunakan pendekatan baru untuk analisis bioinformatik, juga telah memperluaskan katalog gen mikrob yang diketahui, dari 3 hingga 10 juta.
Hasil penyelidikan ini, yang diterbitkan pada hari Rabu oleh jurnal Nature Biotechnology, adalah sebahagian daripada projek MetaHIT Eropah (Metagenomics Human Tractinal Tract), dianugerahkan dengan 11.4 juta euro untuk menyiasat bagaimana microbiome manusia berkaitan dengan kesihatan dan penyakit . The Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) adalah salah satu daripada 13 yang mengambil bahagian dalam projek ini - dan satu-satunya pusat Sepanyol - di bawah arahan Dr. Francisco Guarner, yang menjelaskan bahawa tidak semua sampel yang dikaji mempunyai ini bilangan spesis yang tidak diketahui.
Sampel flora usus beberapa individu mempunyai sangat sedikit spesies ini dan, apabila dianalisis dengan terperinci, telah melihat bahawa mereka adalah sampel pesakit dengan penyakit Crohn. "Ini menunjukkan bahawa spesies ini, sehingga tidak diketahui, mungkin ada yang membuat perbezaan antara mikrobiota orang yang sihat dan yang sakit, " kata Guarner.
Menurut penyelidik, data ini membuka strategi untuk memulihkan spesies ini dengan intervensi pemakanan: mentadbir gentian, prebiotik yang membantu pertumbuhan selektif beberapa spesies atau probiotik.
Bakteria yang tidak diketahui ini mungkin adalah "bakteria yang baik" yang dipanggil kerana mereka bukan tipikal yang menyebabkan jangkitan, dan tidak diketahui atau terpencil sebelum ini. Menurut Guarner, bakteria yang ditemui tidak dapat dipisahkan kerana "hampir pasti mereka tidak akan bertahan di luar kolon untuk dipindahkan."
Orang yang menjaga kerja dan penyelidik VHIR Group of Physiology dan Pathophysiology Digestive telah menunjukkan bahawa spesies baru yang ditemui "tidak dapat ditanam, sangat sensitif terhadap oksigen, iaitu, anaerobes yang sangat ketat dan menimbulkan kebergantungan yang besar terhadap persekitaran mereka untuk dapat bertahan hidup. " "Atas sebab yang sama, apabila kami pergi ke pangkalan data kami tidak menemukan jejak dan sehingga kini kami tidak tahu apa-apa tentang mereka, " kata Guarner.
Penemuan ini mungkin dilakukan dengan pendekatan baru dalam analisis bioinformatik yang membolehkan spesies ini "permukaan".
"Pada masa ini - menurut Guarner - hanya 10% daripada bahan genetik yang diperiksa dikenal dengan kebolehpercayaan 95%. Ini menyebabkan kawasan kelabu besar yang sedang dikerjakan."
Kajian ini telah mengesan 741 spesies metagenomik yang berbeza, yang dinamakan untuk tidak dapat diberikan nama. Apabila dibandingkan dengan pangkalan data, penyelidik telah melihat bahawa 115 spesies ini telah diketahui, manakala 518 tidak diketahui; baki 108 diketahui sebahagiannya.
"Sekarang kita tahu apa genom spesies metagenomik seperti tetapi tidak nama dan nama keluarga mereka, " jelas Guarner.
Terdapat sedikit bilangan spesiesnya yang tidak diketahui, tetapi jenis kelamin atau keluarga yang mereka anggotanya, dan kira-kira 200 spesies metagenomik yang diterangkan tidak dapat diklasifikasikan dengan cara apapun, kerana lebih daripada 80% gen mereka tidak diketahui sepenuhnya hari ini
Menurut saintis, mikroorganisma yang hidup pada manusia adalah kira-kira 100 bilion, 10 kali lebih banyak daripada jumlah sel manusia.
Hasil awal projek yang sama ini, pada tahun 2010, menunjuk kepada 3, 300, 000 gen yang berbeza, diterjemahkan ke dalam 20, 000 fungsi yang berbeza, 5, 000 yang tidak diketahui sejauh ini.
Setiap orang mempunyai kira-kira 600, 000 gen mikrob ini dan 300, 000 diulang secara berterusan di kalangan semua individu. "Dalam kajian baru ini, jumlah itu didarabkan oleh tiga dan 9, 879, 896 gen yang berbeza telah dicapai, " kata Guarner.
Sumber:
Tag:
Kesihatan Potong Dan Kanak-Kanak Diet Dan Pemakanan
Penyelidikan, di mana saintis telah menggunakan pendekatan baru untuk analisis bioinformatik, juga telah memperluaskan katalog gen mikrob yang diketahui, dari 3 hingga 10 juta.
Hasil penyelidikan ini, yang diterbitkan pada hari Rabu oleh jurnal Nature Biotechnology, adalah sebahagian daripada projek MetaHIT Eropah (Metagenomics Human Tractinal Tract), dianugerahkan dengan 11.4 juta euro untuk menyiasat bagaimana microbiome manusia berkaitan dengan kesihatan dan penyakit . The Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) adalah salah satu daripada 13 yang mengambil bahagian dalam projek ini - dan satu-satunya pusat Sepanyol - di bawah arahan Dr. Francisco Guarner, yang menjelaskan bahawa tidak semua sampel yang dikaji mempunyai ini bilangan spesis yang tidak diketahui.
Sampel flora usus beberapa individu mempunyai sangat sedikit spesies ini dan, apabila dianalisis dengan terperinci, telah melihat bahawa mereka adalah sampel pesakit dengan penyakit Crohn. "Ini menunjukkan bahawa spesies ini, sehingga tidak diketahui, mungkin ada yang membuat perbezaan antara mikrobiota orang yang sihat dan yang sakit, " kata Guarner.
"Bakteria yang baik"
Menurut penyelidik, data ini membuka strategi untuk memulihkan spesies ini dengan intervensi pemakanan: mentadbir gentian, prebiotik yang membantu pertumbuhan selektif beberapa spesies atau probiotik.
Bakteria yang tidak diketahui ini mungkin adalah "bakteria yang baik" yang dipanggil kerana mereka bukan tipikal yang menyebabkan jangkitan, dan tidak diketahui atau terpencil sebelum ini. Menurut Guarner, bakteria yang ditemui tidak dapat dipisahkan kerana "hampir pasti mereka tidak akan bertahan di luar kolon untuk dipindahkan."
Orang yang menjaga kerja dan penyelidik VHIR Group of Physiology dan Pathophysiology Digestive telah menunjukkan bahawa spesies baru yang ditemui "tidak dapat ditanam, sangat sensitif terhadap oksigen, iaitu, anaerobes yang sangat ketat dan menimbulkan kebergantungan yang besar terhadap persekitaran mereka untuk dapat bertahan hidup. " "Atas sebab yang sama, apabila kami pergi ke pangkalan data kami tidak menemukan jejak dan sehingga kini kami tidak tahu apa-apa tentang mereka, " kata Guarner.
Spesies metagenomik berbeza
Penemuan ini mungkin dilakukan dengan pendekatan baru dalam analisis bioinformatik yang membolehkan spesies ini "permukaan".
"Pada masa ini - menurut Guarner - hanya 10% daripada bahan genetik yang diperiksa dikenal dengan kebolehpercayaan 95%. Ini menyebabkan kawasan kelabu besar yang sedang dikerjakan."
Kajian ini telah mengesan 741 spesies metagenomik yang berbeza, yang dinamakan untuk tidak dapat diberikan nama. Apabila dibandingkan dengan pangkalan data, penyelidik telah melihat bahawa 115 spesies ini telah diketahui, manakala 518 tidak diketahui; baki 108 diketahui sebahagiannya.
"Sekarang kita tahu apa genom spesies metagenomik seperti tetapi tidak nama dan nama keluarga mereka, " jelas Guarner.
Terdapat sedikit bilangan spesiesnya yang tidak diketahui, tetapi jenis kelamin atau keluarga yang mereka anggotanya, dan kira-kira 200 spesies metagenomik yang diterangkan tidak dapat diklasifikasikan dengan cara apapun, kerana lebih daripada 80% gen mereka tidak diketahui sepenuhnya hari ini
Seseorang mempunyai 600, 000 gen mikrobial
Menurut saintis, mikroorganisma yang hidup pada manusia adalah kira-kira 100 bilion, 10 kali lebih banyak daripada jumlah sel manusia.
Hasil awal projek yang sama ini, pada tahun 2010, menunjuk kepada 3, 300, 000 gen yang berbeza, diterjemahkan ke dalam 20, 000 fungsi yang berbeza, 5, 000 yang tidak diketahui sejauh ini.
Setiap orang mempunyai kira-kira 600, 000 gen mikrob ini dan 300, 000 diulang secara berterusan di kalangan semua individu. "Dalam kajian baru ini, jumlah itu didarabkan oleh tiga dan 9, 879, 896 gen yang berbeza telah dicapai, " kata Guarner.
Sumber:
